慢性肾炎反复发作的原因有多种,包括治疗、饮食和日常注意等等。从治疗方面来说，有些患者没有接受正规有效的治疗，反而应用了一些对肾脏有肾毒性的药物，不仅花了不少的冤枉钱,有的甚至加重了肾脏的损伤，导致进入了肾功能不全阶段。
有的患者仅仅单纯的应用一些对症治疗的药物如激素和免疫抑制剂，当时治疗有可能会有效，但是因为没能从根本上治疗慢性肾炎，没有修复受损的肾脏固有细胞，肾脏损伤继续存在，一段时间后还会复发，总之导致慢性肾炎反复发作主要在于治疗方法的不得当和治疗的不彻底。
目前研究发现肾脏病之所以难治是因为超敏反应的持续作用，超敏反应之所以发生在肾脏器官中是因为大量的免疫复合物和类似于免疫复合物的人体异物沉积在肾脏器官中。
免疫复合物之所以产生是因为机体的免疫缺陷和体外异物的对机体的反复攻击，因此要想让慢性肾炎病情不复发最主要的是采用中西医结合治疗，通过固肾培元，养血活络，平衡阴阳，双向调节机体免疫，修复肾脏固有细胞和组织。